MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus cereus biovar anthracis str. CI plasmid pBAslCI14

Total Repeats: 332

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014333	TAC	2	6	48	53	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014333	TTG	2	6	69	74	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014333	TGA	2	6	146	151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300885231
4	NC_014333	TTC	2	6	258	263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300885231
5	NC_014333	TCT	2	6	434	439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300885231
6	NC_014333	TCCTC	2	10	451	460	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
7	NC_014333	CTT	2	6	475	480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300885232
8	NC_014333	TCT	3	9	508	516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300885232
9	NC_014333	TCA	2	6	529	534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300885232
10	NC_014333	TA	3	6	586	591	50 %	50 %	0 %	0 %	300885232
11	NC_014333	TTC	2	6	642	647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300885232
12	NC_014333	AT	3	6	660	665	50 %	50 %	0 %	0 %	300885232
13	NC_014333	CTC	2	6	708	713	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300885232
14	NC_014333	CCT	2	6	790	795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300885233
15	NC_014333	TCT	2	6	827	832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300885233
16	NC_014333	ACC	2	6	835	840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300885233
17	NC_014333	TCTTCA	2	12	923	934	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	300885233
18	NC_014333	TCA	2	6	945	950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300885233
19	NC_014333	CTC	2	6	985	990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300885233
20	NC_014333	TCA	2	6	1007	1012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300885233
21	NC_014333	ATC	2	6	1027	1032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300885233
22	NC_014333	TAT	2	6	1033	1038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300885233
23	NC_014333	GAT	2	6	1039	1044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300885233
24	NC_014333	ATC	2	6	1087	1092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300885233
25	NC_014333	ATCT	2	8	1105	1112	25 %	50 %	0 %	25 %	300885233
26	NC_014333	T	6	6	1136	1141	0 %	100 %	0 %	0 %	300885233
27	NC_014333	GTT	2	6	1155	1160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300885233
28	NC_014333	ACT	2	6	1172	1177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300885233
29	NC_014333	GAA	2	6	1190	1195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300885234
30	NC_014333	CTT	2	6	1254	1259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300885234
31	NC_014333	TAA	2	6	1274	1279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300885234
32	NC_014333	TCA	2	6	1282	1287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300885234
33	NC_014333	TCTTT	2	10	1289	1298	0 %	80 %	0 %	20 %	300885234
34	NC_014333	GAA	2	6	1323	1328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300885234
35	NC_014333	CTAG	2	8	1330	1337	25 %	25 %	25 %	25 %	300885234
36	NC_014333	AGT	2	6	1346	1351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300885234
37	NC_014333	AATA	2	8	1383	1390	75 %	25 %	0 %	0 %	300885234
38	NC_014333	TCTCAA	2	12	1415	1426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300885234
39	NC_014333	A	7	7	1458	1464	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014333	CTT	2	6	1523	1528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300885235
41	NC_014333	AGA	2	6	1563	1568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300885235
42	NC_014333	AAC	2	6	1578	1583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300885235
43	NC_014333	CCG	2	6	1604	1609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300885235
44	NC_014333	ACT	2	6	1674	1679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300885235
45	NC_014333	CAT	2	6	1700	1705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300885235
46	NC_014333	TCA	2	6	1732	1737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300885235
47	NC_014333	CTT	2	6	1740	1745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300885235
48	NC_014333	TCC	2	6	1831	1836	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300885235
49	NC_014333	CTT	2	6	1872	1877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300885235
50	NC_014333	ATT	2	6	1897	1902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300885235
51	NC_014333	TC	3	6	1954	1959	0 %	50 %	0 %	50 %	300885236
52	NC_014333	TAA	2	6	1961	1966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300885236
53	NC_014333	CAA	2	6	1990	1995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300885236
54	NC_014333	CCT	2	6	2032	2037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300885236
55	NC_014333	ATG	2	6	2232	2237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300885236
56	NC_014333	T	6	6	2261	2266	0 %	100 %	0 %	0 %	300885236
57	NC_014333	C	6	6	2301	2306	0 %	0 %	0 %	100 %	300885236
58	NC_014333	TTC	2	6	2309	2314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300885236
59	NC_014333	ACG	2	6	2315	2320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300885236
60	NC_014333	TCCT	2	8	2356	2363	0 %	50 %	0 %	50 %	300885237
61	NC_014333	TCTT	2	8	2412	2419	0 %	75 %	0 %	25 %	300885237
62	NC_014333	TTA	2	6	2475	2480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300885237
63	NC_014333	CTT	2	6	2482	2487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300885237
64	NC_014333	T	6	6	2510	2515	0 %	100 %	0 %	0 %	300885237
65	NC_014333	TCT	2	6	2541	2546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300885237
66	NC_014333	TTC	2	6	2561	2566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300885237
67	NC_014333	GTC	2	6	2568	2573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300885237
68	NC_014333	ATC	2	6	2578	2583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_014333	CTC	2	6	2584	2589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_014333	TAC	2	6	2590	2595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_014333	CAA	2	6	2673	2678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_014333	TAC	2	6	2684	2689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_014333	TAG	2	6	2692	2697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014333	TAA	2	6	2752	2757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014333	AAT	2	6	2809	2814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014333	GA	3	6	2828	2833	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014333	AGG	2	6	2836	2841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014333	AAT	2	6	2962	2967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300885238
79	NC_014333	TTA	2	6	2982	2987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300885238
80	NC_014333	AAG	2	6	3053	3058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300885238
81	NC_014333	ATC	2	6	3078	3083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300885238
82	NC_014333	GCC	2	6	3172	3177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300885238
83	NC_014333	TAA	2	6	3227	3232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300885238
84	NC_014333	CAA	2	6	3238	3243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300885238
85	NC_014333	CAA	2	6	3334	3339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300885238
86	NC_014333	CAA	3	9	3352	3360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300885238
87	NC_014333	AGA	2	6	3402	3407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300885238
88	NC_014333	GAAG	2	8	3412	3419	50 %	0 %	50 %	0 %	300885238
89	NC_014333	GAAG	2	8	3423	3430	50 %	0 %	50 %	0 %	300885238
90	NC_014333	A	7	7	3437	3443	100 %	0 %	0 %	0 %	300885238
91	NC_014333	AAC	2	6	3455	3460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300885238
92	NC_014333	ATGA	2	8	3481	3488	50 %	25 %	25 %	0 %	300885238
93	NC_014333	TCA	2	6	3504	3509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300885238
94	NC_014333	TTC	2	6	3535	3540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300885238
95	NC_014333	TTC	2	6	3547	3552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300885238
96	NC_014333	CCT	2	6	3580	3585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_014333	AATA	2	8	3639	3646	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014333	AGTA	2	8	3687	3694	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014333	T	7	7	3752	3758	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014333	T	6	6	3763	3768	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014333	TTTA	2	8	3810	3817	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014333	GTAA	2	8	3918	3925	50 %	25 %	25 %	0 %	300885239
103	NC_014333	AAT	2	6	3929	3934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300885239
104	NC_014333	ATG	2	6	3991	3996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300885239
105	NC_014333	AGA	2	6	4030	4035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300885239
106	NC_014333	GAA	2	6	4105	4110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300885239
107	NC_014333	AT	3	6	4159	4164	50 %	50 %	0 %	0 %	300885239
108	NC_014333	ATC	2	6	4205	4210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300885239
109	NC_014333	CAA	2	6	4352	4357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_014333	ATA	3	9	4397	4405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014333	ATT	2	6	4466	4471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300885240
112	NC_014333	CGC	2	6	4507	4512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300885240
113	NC_014333	T	7	7	4546	4552	0 %	100 %	0 %	0 %	300885240
114	NC_014333	T	6	6	4576	4581	0 %	100 %	0 %	0 %	300885240
115	NC_014333	GAT	2	6	4624	4629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300885240
116	NC_014333	TAT	2	6	4630	4635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300885240
117	NC_014333	A	6	6	4639	4644	100 %	0 %	0 %	0 %	300885240
118	NC_014333	CA	3	6	4705	4710	50 %	0 %	0 %	50 %	300885240
119	NC_014333	AGG	2	6	4761	4766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300885240
120	NC_014333	TGG	2	6	4769	4774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300885240
121	NC_014333	TAAT	2	8	4831	4838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014333	AGG	2	6	4853	4858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014333	CTT	2	6	4910	4915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_014333	ATT	2	6	4923	4928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014333	GAAA	2	8	4937	4944	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014333	AG	3	6	4973	4978	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014333	AGG	2	6	4996	5001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014333	A	7	7	5012	5018	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014333	GA	3	6	5029	5034	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014333	TAT	2	6	5059	5064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014333	T	6	6	5068	5073	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014333	GAA	2	6	5120	5125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014333	A	7	7	5124	5130	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014333	TAAG	2	8	5137	5144	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014333	TAC	2	6	5159	5164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_014333	AT	3	6	5180	5185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014333	ACA	3	9	5203	5211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_014333	AGTA	2	8	5257	5264	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014333	GTG	2	6	5292	5297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014333	TGA	2	6	5305	5310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014333	T	6	6	5351	5356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014333	ATA	2	6	5371	5376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014333	CAC	2	6	5418	5423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
144	NC_014333	ATA	2	6	5434	5439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014333	CTT	2	6	5456	5461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_014333	TCT	3	9	5506	5514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_014333	T	6	6	5514	5519	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014333	AAC	2	6	5530	5535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_014333	TTC	2	6	5542	5547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_014333	ATCA	2	8	5556	5563	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_014333	T	6	6	5662	5667	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_014333	GCT	2	6	5752	5757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_014333	AGAC	2	8	5760	5767	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
154	NC_014333	GAAA	2	8	5782	5789	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
155	NC_014333	A	6	6	5793	5798	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_014333	GA	3	6	5816	5821	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
157	NC_014333	T	7	7	5834	5840	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_014333	CTTG	2	8	5847	5854	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
159	NC_014333	ACC	2	6	5996	6001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
160	NC_014333	GGC	2	6	6217	6222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300885241
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165	NC_014333	TAA	2	6	6366	6371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300885241
166	NC_014333	T	6	6	6504	6509	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_014333	TCA	2	6	6583	6588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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170	NC_014333	AGG	2	6	6787	6792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
171	NC_014333	CCT	2	6	6812	6817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
172	NC_014333	CT	3	6	6846	6851	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
173	NC_014333	TTC	2	6	6916	6921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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278	NC_014333	TGC	2	6	11685	11690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300885246
279	NC_014333	TTG	2	6	11721	11726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300885246
280	NC_014333	CGC	2	6	11748	11753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300885246
281	NC_014333	CTG	2	6	11768	11773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300885246
282	NC_014333	TGTT	2	8	11816	11823	0 %	75 %	25 %	0 %	300885246
283	NC_014333	CTG	2	6	11831	11836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300885246
284	NC_014333	CTT	2	6	11951	11956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300885246
285	NC_014333	ATG	2	6	11966	11971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300885246
286	NC_014333	ACG	2	6	11985	11990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300885246
287	NC_014333	GTAG	2	8	12066	12073	25 %	25 %	50 %	0 %	300885246
288	NC_014333	TGT	2	6	12117	12122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300885246
289	NC_014333	CAT	2	6	12135	12140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300885246
290	NC_014333	TGC	2	6	12185	12190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300885246
291	NC_014333	TTG	2	6	12237	12242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300885246
292	NC_014333	TTA	2	6	12318	12323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_014333	TC	3	6	12359	12364	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
294	NC_014333	T	6	6	12368	12373	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
295	NC_014333	GGA	2	6	12427	12432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
296	NC_014333	ATA	2	6	12435	12440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
297	NC_014333	TGT	2	6	12471	12476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
298	NC_014333	TAT	2	6	12482	12487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
299	NC_014333	A	6	6	12514	12519	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
300	NC_014333	GA	3	6	12611	12616	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
301	NC_014333	TAA	2	6	12757	12762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300885247
302	NC_014333	TTG	2	6	12903	12908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300885247
303	NC_014333	GA	3	6	12983	12988	50 %	0 %	50 %	0 %	300885247
304	NC_014333	GAC	2	6	13038	13043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300885247
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308	NC_014333	GAAA	2	8	13155	13162	75 %	0 %	25 %	0 %	300885247
309	NC_014333	TATT	2	8	13217	13224	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
310	NC_014333	TAAT	2	8	13248	13255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
311	NC_014333	AAG	2	6	13335	13340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
312	NC_014333	CAA	3	9	13433	13441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
313	NC_014333	TCA	2	6	13451	13456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
314	NC_014333	AT	3	6	13469	13474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
315	NC_014333	A	6	6	13480	13485	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
316	NC_014333	CTT	3	9	13506	13514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
317	NC_014333	T	6	6	13513	13518	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
318	NC_014333	TA	3	6	13530	13535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
319	NC_014333	AGGG	2	8	13537	13544	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
320	NC_014333	TATTT	2	10	13553	13562	20 %	80 %	0 %	0 %	300885248
321	NC_014333	T	6	6	13560	13565	0 %	100 %	0 %	0 %	300885248
322	NC_014333	AGT	2	6	13585	13590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300885248
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325	NC_014333	TCCTC	2	10	13885	13894	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
326	NC_014333	CTT	2	6	13909	13914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
327	NC_014333	TCT	3	9	13942	13950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
328	NC_014333	TCA	2	6	13963	13968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
329	NC_014333	TA	3	6	14020	14025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
330	NC_014333	TCT	2	6	14077	14082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
331	NC_014333	AT	3	6	14094	14099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
332	NC_014333	CTC	2	6	14142	14147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.